囊肿型痘痘因为比较重，外用药效果不会很好，因此治疗以口服药物为主，口服的药物可以选择盐酸米诺环素等抗生素，也可以用维甲酸类的药物，像异维A酸胶丸，可以先用盐酸米诺环素3-6周的时间，让炎症有比较好的控制，再改成异维A酸胶丸，可以用4-6个月减少的复发。
如果开始直接用异维A酸胶丸，有少数的病人会有痤疮突然加重的情况，因此可以选择先用盐酸米诺环素，后改为异维A酸胶丸。
痤疮和身体的状态有关系，比如熬夜多、着急、上火的事多就容易重，因此要调整好工作和生活的状态，饮食上要少吃油的、辣的食物。除了饮食、生活的调整、口服药物之外，还可以做红蓝光的治疗或者光动力治疗，也是辅助的有效治疗方法。
