大黄花鱼和小黄花鱼在外形、地理分布、营养作用上有区别：
一、外形上的不同
大黄鱼（Larimichthys crocea）体长约40-50cm，腹部呈金黄色，头呈钝尖形，尾柄细长。此外，大黄鱼腹部还有多列发光颗粒，从不同的角度看，腹部的颜色也会呈现出不同程度的变化。小黄鱼长的和大黄鱼非常相似，但是体型较小，一般体长为16~25cm，体重约为200~300g。
大黄鱼臀鳍鳍条数为7-9条，一般情况为8条，尾柄较细长，长度是高度的3倍；小黄鱼的臀鳍鳍条数为9-10条，一般情况为9条，尾柄相对较粗短，长度是高度的2倍。大黄鱼鳞片比较小，而小黄鱼鳞片比较大。
二、地理分布
大黄鱼主要分布在我国沿海地区，南起南海，北至东海中部以南，朝鲜西海岸和日本南部海域；小黄鱼主要分布在我国渤海、黄海、东海和朝鲜西南海岸，两者在分布上略有重叠。
三、营养作用不同
小黄花鱼：小黄花鱼含有丰富的蛋白质、糖、脂肪、钙、磷、铁、钾、钠、镁、硒和维生素A等人体所需的多种营养成分，食用价值高，而且无论从中国传统医学还是现代医学研究中，都发现小黄鱼还具有相当高的药用价值，例如鱼鳔具有润肺、健脾、补气血的功效，胆能清热解毒、平肝、降血脂，鱼磷可制药用胶，精巢用来提取鱼精蛋白、精氨酸，卵巢则可用于提取卵磷脂。
大黄花鱼：大黄花鱼肉质较好且味美，松鼠黄鱼为筵席佳肴，大部分鲜销，其他盐渍成“瓜鲞”，去内脏盐渍后洗清晒干制成“黄鱼鲞”或制成罐头，鱼鳔可干制成名贵食品“鱼肚”，又可制“黄鱼胶”，肝脏含维生素A，为制鱼肝油的好原料，耳石可作药用。
