1、用途不一样：
飞秒激光在物理学、生物学、化学控制反应、光通讯等领域中得到了广泛应用。准分子激光广泛应用在临床医学以及科学研究与工业应用方面。
2、特点不一样：
飞秒激光是我们人类目前在实验条件下能够获得的最短脉冲，它的精确度是±5微米。有非常高的瞬间功率，它的瞬间功率可达百万亿瓦，比全世界的发电总功率还要多出上百倍。准分子激光是氟氢气体混合后经激发产生一种人眼看不见的超紫外线的光束，属冷激光，能精确消融人眼角膜预计要除掉部分，而不损伤周围组织和其他组织器官，它的效果是永久性的。
3、时间不一样：
飞秒激光(第一台红宝石激光器)于1960年问世。准分子激光于1970在莫斯科物理研究所发明。
准分子激光
是一种气体脉冲激光，所产生的是波长为193nm的准分子激光，它是一种超紫外线光波，此波长的激光吸收范围窄，激光的能量几乎完全被角膜上皮细胞和基质吸收，超过这个范围的组织不会吸收到激光，每一个激光脉冲可以切削0.2到0.25um厚度的生物组织，所以眼睛周围的组织不会损伤。
飞秒激光
则被视为神秘之光，是一种以脉冲形式运转的激光，持续时间非常短，飞秒就是1/1000万亿秒，它比利用电子学方法所获得的短脉冲要短几千倍，是人类目前在实验条件下所能获得的短脉冲。飞秒激光和一般的准分子激光是两种不同的激光，运用在近视手术上也有些不同。
